19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3247 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3247  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3952  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4067  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3859  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3886  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3767  hypothetical protein  32.63 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2708  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00105  hypothetical protein  31.58 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1462  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1942  hypothetical protein  29.29 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00191873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0098  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4302  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4442  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4247  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6241  hypothetical protein  32.65 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2802  hypothetical protein  32 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4971  hypothetical protein  29.7 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0203  hypothetical protein  30.3 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4187  hypothetical protein  34.31 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>