67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2278 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  36.18 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  39.58 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  32.1 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  28.4 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  28.28 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  30.52 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.67 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  32.67 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  32.89 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  28.77 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  30.67 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  30.82 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.77 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.15 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  30.26 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  30.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  31.94 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  30.13 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  26.14 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  27.11 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  29.93 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  24.22 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  24.39 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.5 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  24.39 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2916  rare lipoprotein B precursor  24.83 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  23.6 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  27.45 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.9 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.31 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.31 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.31 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  27.5 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  27.27 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  28.28 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  29.58 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.94 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  25.74 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  28.08 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  30.14 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  26.53 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  27.44 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  27.63 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  25.95 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  28.17 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  27.08 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  23.65 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  29.08 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  23.65 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  23.65 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  24.32 
 
 		 183 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>