91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1367 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  347  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  57.76 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  49.12 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  47.37 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  47.37 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  47.02 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  47.02 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.4 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  46.78 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  45.09 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  46.2 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  46.78 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  46.2 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  45.4 
 
 		 208 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  46.2 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  48.08 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  47.02 
 
 		 169 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  47.44 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  45.88 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  47.44 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  43.45 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  44.71 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  42.77 
 
 		 174 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  44.25 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  47.02 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  49.36 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  44.94 
 
 		 159 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  45.03 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  44.38 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  41.07 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  46.15 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  42.21 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  42.77 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  47.5 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  40.88 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  41.71 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  40.12 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  41.14 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  32.78 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  40.35 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  36.72 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  33.94 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  30.6 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  35.58 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  36.13 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  34.5 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  31.82 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  36.44 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  33.03 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  28.8 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.46 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  34.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  34.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  28.82 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.69 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  29.1 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  29.25 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  37.68 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  26.61 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  26.99 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  31.34 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  28.81 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  30.63 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  31.34 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  26.05 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  34.72 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  27.72 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  26.79 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  24.58 
 
 		 151 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  25.58 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  29.2 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  27.78 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>