30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0478 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 		 328 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  53.18 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  52.06 
 
 		 334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  46.95 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  41.1 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  42.21 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  40.59 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  38.31 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  41.18 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  38.56 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  38.56 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  42.67 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  35.56 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  35.42 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  36.39 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  35.56 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  32.15 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.6 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  31.83 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.7 
 
 		 359 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  34.49 
 
 		 779 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  30.97 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  32.89 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.24 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  34.12 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  26.52 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  28.65 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>