26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0476 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  100 
 
 		 350 aa  719    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  30.03 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  28.67 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  28.14 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  27.08 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  25.24 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  26.98 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.35 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  23.05 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.06 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.63 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  26.48 
 
 		 779 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  25.09 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.27 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.96 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  23.76 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  25.08 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  27.86 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  23.92 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  24.47 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  25.44 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.89 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  25.44 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  25.86 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>