21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3103 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  100 
 
 
835 aa  1650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  45.8 
 
 
870 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  31.1 
 
 
713 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  29.49 
 
 
706 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  31.12 
 
 
814 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  27.93 
 
 
884 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  27.81 
 
 
919 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  31.76 
 
 
820 aa  148  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  26.89 
 
 
784 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  28.18 
 
 
751 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  26.05 
 
 
873 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  24.26 
 
 
764 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  27.92 
 
 
717 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  26.81 
 
 
728 aa  75.5  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  29.62 
 
 
703 aa  71.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  24.49 
 
 
706 aa  68.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  25.54 
 
 
820 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  23.78 
 
 
718 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  24.78 
 
 
741 aa  54.3  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  28.23 
 
 
711 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  22.59 
 
 
905 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>