21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2935 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2935  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.508874  normal  0.458418 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4537  hypothetical protein  52.56 
 
 
167 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  52.63 
 
 
356 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3044  hypothetical protein  45.76 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0131759  hitchhiker  0.00697344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1409  hypothetical protein  59.46 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1809  hypothetical protein  29.49 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00804246  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1018  hypothetical protein  29.49 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.299945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4984  hypothetical protein  41.51 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128229  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  37.7 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  37.7 
 
 
362 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>