15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2764 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2764  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195204  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0415  protein of unknown function DUF450  53.59 
 
 
212 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0405  protein of unknown function DUF450  53.11 
 
 
212 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0103  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  184  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2176  protein of unknown function DUF450  46.89 
 
 
211 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0318723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0436  hypothetical protein  46.38 
 
 
208 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120697  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0218  protein of unknown function DUF450  50.72 
 
 
207 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0215  protein of unknown function DUF450  50.72 
 
 
207 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0207783  hitchhiker  0.00936489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3445  protein of unknown function DUF450  44.33 
 
 
207 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00357557  hitchhiker  0.00000000457107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1836  protein of unknown function DUF450  41.8 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2368  protein of unknown function DUF450  36.6 
 
 
216 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3652  hypothetical protein  30.11 
 
 
211 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1804  hypothetical protein  40.66 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341919  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2115  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  28.74 
 
 
796 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>