27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4966 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  100 
 
 
706 aa  1417    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  33.78 
 
 
713 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  28.92 
 
 
835 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  31.05 
 
 
820 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  30.25 
 
 
814 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  32.23 
 
 
870 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  28.99 
 
 
884 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  28.53 
 
 
919 aa  150  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  26.85 
 
 
784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  24.84 
 
 
751 aa  95.1  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  25.63 
 
 
873 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  25.92 
 
 
764 aa  87.4  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  27.39 
 
 
717 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  25.18 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  22.78 
 
 
718 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  26.94 
 
 
706 aa  62.4  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  25 
 
 
820 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  34.46 
 
 
809 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  34.46 
 
 
809 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  34.46 
 
 
809 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  32.12 
 
 
802 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  32.41 
 
 
804 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  34.31 
 
 
811 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  24.65 
 
 
703 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  31.79 
 
 
831 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  24.04 
 
 
711 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  24.45 
 
 
728 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>