23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4648 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
390 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  62.86 
 
 
395 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  53.44 
 
 
405 aa  342  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  52.11 
 
 
381 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  44.83 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  45.93 
 
 
399 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  45.03 
 
 
420 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  42.93 
 
 
436 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  46.44 
 
 
412 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  44.33 
 
 
367 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  45.79 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  42.47 
 
 
412 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  43.78 
 
 
242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  38.83 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  33.19 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  46.55 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.27 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  33.33 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  24.84 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  27.41 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3589  Lantibiotic modifying protein-like protein  32.46 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  35.21 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>