13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1596 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1596  hypothetical protein  100 
 
 
771 aa  1527    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0249858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1597  hypothetical protein  37.87 
 
 
763 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1266  hypothetical protein  37.74 
 
 
990 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4439  hypothetical protein  33.55 
 
 
827 aa  87.4  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041911  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1072  hypothetical protein  35.48 
 
 
704 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4046  hypothetical protein  32.89 
 
 
799 aa  84  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.850338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1672  hypothetical protein  35.26 
 
 
150 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.221863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3430  hypothetical protein  35.25 
 
 
284 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0470  hypothetical protein  36.19 
 
 
426 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10770  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.730122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9101  hypothetical protein  26.02 
 
 
309 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2220  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122347  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04050  hypothetical protein  27.81 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0246073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>