16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1429 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1429  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
418 aa  828    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1047  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  62.59 
 
 
409 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.112794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1933  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  59.12 
 
 
322 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0170719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4166  hypothetical protein  50.52 
 
 
738 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.530303  normal  0.0503721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4558  WD-40 repeat protein  26.87 
 
 
1125 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0563  hypothetical protein  43.59 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1932  hypothetical protein  60.34 
 
 
57 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0393  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.26 
 
 
641 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4560  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 
1116 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2994  hypothetical protein  46.15 
 
 
237 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0470  hypothetical protein  33.33 
 
 
477 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.896601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4705  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3738  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1546  hypothetical protein  39.47 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0191  hypothetical protein  39.39 
 
 
609 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4314  hypothetical protein  30.17 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>