84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0956 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.09 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  47.4 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  44.89 
 
 		 175 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  43.71 
 
 		 208 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  44 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  47.9 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  43.11 
 
 		 212 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  41.81 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  44.3 
 
 		 210 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  44.31 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  44.31 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  48.72 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  43.11 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  44.38 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  42.29 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  40.23 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  40.61 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  43.79 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  43.79 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  43.79 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  41.32 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  41.52 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  42.6 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  42.01 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  42.5 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  42.51 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  42.51 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  42.51 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  42.51 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  42.51 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  40.72 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  41.11 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  41.32 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  41.92 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  40.13 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  39.52 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  41.79 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.87 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  31.55 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  31.38 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  29.65 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  31.29 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  41.35 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  29.76 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  26.9 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  32.04 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  32.84 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  32.26 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  32.26 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  32.08 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  25.7 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  31.06 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  30.09 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  30.82 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  31.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  31.5 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  32.8 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  29.69 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  34.26 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  30.4 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  32.46 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  30.43 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  35.04 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  25.86 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  39.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  26.16 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  28.45 
 
 		 151 aa  44.3  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  34.83 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  26.13 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  25.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  28.46 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  27.13 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  29.41 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>