69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0557 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  39.16 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  33.58 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  35.25 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  36.72 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  36.29 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  37.19 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36.54 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  37.69 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  39.74 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  37.9 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  29.27 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  35.56 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  33.11 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  36.15 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  40.65 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  41.32 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  38.4 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  37.6 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  37.23 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  32.84 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  37.4 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  38.24 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  36.97 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  39.02 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  38.84 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  38.78 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  36.67 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  43.24 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  39.78 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  39.47 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  28.67 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  47.37 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  34.53 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  32.2 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  31.36 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.56 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  30.97 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  26.35 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  30.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  27.64 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  35.79 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  29.84 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  27.42 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  31.76 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  30.21 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  34.02 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1826  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  24.78 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  27.27 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  27.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  24.78 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  32.63 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>