46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1573 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  54.72 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  54.1 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  50.94 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  55.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0645  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0861404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  40 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  43.33 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  48.98 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  39.62 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  46 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  47.73 
 
 
45 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3377  hypothetical protein  63.33 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  46.43 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04219  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04185  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5865  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4879  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4893  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4502  hypothetical protein  39.34 
 
 
65 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.594956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3713  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828713  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3644  protein of unknown function DUF466  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4634  hypothetical protein  39.34 
 
 
65 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4945  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4640  hypothetical protein  39.34 
 
 
65 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4573  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4272  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562611  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2938  hypothetical protein  38.78 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.888037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3064  hypothetical protein  38.78 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3026  protein of unknown function DUF466  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00566  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559075  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0619  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0650  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00555  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0619  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.593991  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0684  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3045  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0501  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>