13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1082 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  752    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  59.04 
 
 
377 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  46.35 
 
 
395 aa  285  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  44.25 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  44.05 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  41.05 
 
 
372 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  38.21 
 
 
378 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  30.3 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  28.33 
 
 
411 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  29.37 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  36.04 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  33.62 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  28.45 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>