13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0955 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0955  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  202  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.804421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1750  hypothetical protein  54.13 
 
 
112 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3860  hypothetical protein  57.53 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0808  hypothetical protein  37.31 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1331  hypothetical protein  45.83 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5630  hypothetical protein  53.49 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0556  hypothetical protein  41.07 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0916  hypothetical protein  40.98 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.398977  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1320  hypothetical protein  37.88 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3756  hypothetical protein  43.86 
 
 
98 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.780957  hitchhiker  0.00927963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19990  hypothetical protein  33.64 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.145049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6668  hypothetical protein  41.18 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117127  normal  0.660583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2358  hypothetical protein  39.58 
 
 
132 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>