12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0851 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 173 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  42.67 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  49.32 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  36.55 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  44.44 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  42.25 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  46.97 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  35.85 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  30.34 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3386  rod shape-determining protein MreD  40.26 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.266152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>