11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1438 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1438  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  333  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0365666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  32.43 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  36 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  31.87 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  38.83 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  35.51 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  35.42 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1337  hypothetical protein  32.86 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  38.1 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>