13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1436 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  319  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0317201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  28.65 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  28.74 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  31.64 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  30.29 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  27.81 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  28.81 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  32.14 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  33.65 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  27.59 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  30.13 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  30.21 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>