26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1277 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 
395 aa  766    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  32.52 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  32.52 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  32.21 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.67 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1444  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.58 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  32.21 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  32.07 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  29.87 
 
 
328 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  28.24 
 
 
316 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.58 
 
 
327 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  31.9 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  27.4 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  34.1 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  28.22 
 
 
335 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.05 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  29.59 
 
 
456 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  29.71 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  30.77 
 
 
309 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  26.99 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  23.24 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  32.76 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  34.68 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  31.19 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  33.83 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>