10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3780 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3535  hypothetical protein  62.64 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0647  hypothetical protein  56.68 
 
 		 283 aa  298  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0913041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0486  hypothetical protein  57.42 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0970  hypothetical protein  31.43 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.431239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1716  hypothetical protein  31.42 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6246  hypothetical protein  32.78 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2077  hypothetical protein  29.96 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0447  hypothetical protein  30.17 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>