12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2343 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0307  hypothetical protein  53.7 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1000  hypothetical protein  61.7 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204036  normal  0.73621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1001  hypothetical protein  61.7 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473211  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0999  hypothetical protein  51.85 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0960019  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6025  hypothetical protein  55.56 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1131  hypothetical protein  59.52 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1132  hypothetical protein  59.52 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0560  hypothetical protein  53.49 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2783  hypothetical protein  53.49 
 
 		 235 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00277795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3609  hypothetical protein  49.06 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2344  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>