13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2062 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2062  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0647  hypothetical protein  44.66 
 
 		 105 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.173269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1552  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0311894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1562  hypothetical protein  39.78 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00388026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3799  hypothetical protein  31.96 
 
 		 106 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.830774  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1970  hypothetical protein  35 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2117  hypothetical protein  31.96 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178867  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2092  hypothetical protein  35 
 
 		 106 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2392  hypothetical protein  35.44 
 
 		 111 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0467804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33580  hypothetical protein  34.62 
 
 		 109 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312917  normal  0.0307116 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3597  hypothetical protein  30.21 
 
 		 108 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.879973  normal  0.208476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2854  hypothetical protein  34.62 
 
 		 109 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>