9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2438 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2438  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 477 aa  885    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149631  normal  0.0919681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3901  hypothetical protein  43.04 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1276  Ycf66 family protein  32.33 
 
 		 313 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0481  Ycf66 family protein  45.45 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2673  Ycf66 family protein  45.45 
 
 		 372 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3431  Ycf66 family protein  45.45 
 
 		 372 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2526  hypothetical protein  43.04 
 
 		 251 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.766942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4866  Ycf66 family protein  39.84 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0831  hypothetical protein  37.01 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>