10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1828 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  173  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4405  tryptophan-rich Ignore  62.5 
 
 		 80 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1510  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1537  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.49347  normal  0.0252644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2333  hypothetical protein  61.73 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4308  hypothetical protein  61.97 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2307  hypothetical protein  57.69 
 
 		 80 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0426  hypothetical protein  63.77 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9878  predicted protein  39.34 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12451  hypothetical protein  32.81 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>