18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0917 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0917  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542484  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4711  hypothetical protein  46.59 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000940338  normal  0.30347 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3626  NIL domain-containing protein  43.18 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1683  hypothetical protein  44 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0592602  normal  0.304725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2749  hypothetical protein  45.21 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3353  hypothetical protein  45.21 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.549203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2761  hypothetical protein  40.74 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3453  hypothetical protein  38.96 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0464  hypothetical protein  43.94 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.888527  normal  0.158996 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0809  iron-sulfur cluster-binding protein  31.43 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2838  hypothetical protein  39.71 
 
 
215 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.21158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0774678  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.07 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.72 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  36.51 
 
 
133 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  34.85 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0733  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  29.49 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  34.78 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>