14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0548 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0548  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1544  hypothetical protein  29.84 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  0.0311117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5207  hypothetical protein  34.24 
 
 
239 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0548  hypothetical protein  30.53 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1799  hypothetical protein  25.74 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3423  hypothetical protein  42.34 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1172  hypothetical protein  30.92 
 
 
265 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.2622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14391  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1303  hypothetical protein  30.26 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.2986  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1517  hypothetical protein  49.21 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1512  hypothetical protein  47.14 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0368  hypothetical protein  22.28 
 
 
230 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10501  hypothetical protein  20.65 
 
 
230 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126382  hitchhiker  0.00255775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1742  hypothetical protein  48.84 
 
 
226 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>