21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0412 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0412  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  211  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4494  hypothetical protein  53.33 
 
 
107 aa  120  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.847171  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4746  hypothetical protein  62.35 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3163  hypothetical protein  55.24 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1517  hypothetical protein  49.5 
 
 
101 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1489  hypothetical protein  49.5 
 
 
101 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4941  hypothetical protein  53.12 
 
 
100 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.03339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2081  hypothetical protein  52.94 
 
 
105 aa  96.7  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150921  hitchhiker  0.0000183308 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27150  predicted protein  44.79 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.426071  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29759  predicted protein  44.79 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.288001  hitchhiker  0.00675185 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46071  predicted protein  50.6 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18151  hypothetical protein  35.4 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0672112 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05741  hypothetical protein  29.91 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0989  hypothetical protein  40.96 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0895  hypothetical protein  34.29 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.89338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06261  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.704095  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0007  hypothetical protein  27.62 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.230016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0571  hypothetical protein  26.67 
 
 
106 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.103428  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06271  hypothetical protein  26.67 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05971  hypothetical protein  25.71 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06361  hypothetical protein  25.88 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>