18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1164 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1164  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  6e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.409237  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1311  hypothetical protein  88.03 
 
 
145 aa  214  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10451  hypothetical protein  54.81 
 
 
183 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.410905  hitchhiker  0.000895749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0363  hypothetical protein  52.99 
 
 
183 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09181  hypothetical protein  49.64 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0967635  hitchhiker  0.00000740228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14441  hypothetical protein  58.73 
 
 
169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09211  hypothetical protein  43.59 
 
 
319 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10231  hypothetical protein  44.19 
 
 
192 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1908  hypothetical protein  48.31 
 
 
144 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.240356  normal  0.623306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2962  hypothetical protein  44.6 
 
 
188 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178199  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10241  hypothetical protein  42.64 
 
 
187 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0955  hypothetical protein  43.41 
 
 
192 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.660516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1808  hypothetical protein  44.12 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4956  hypothetical protein  41.8 
 
 
205 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4979  hypothetical protein  40.16 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.751664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4346  hypothetical protein  42.14 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4408  hypothetical protein  42.14 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  hitchhiker  0.00217663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5012  hypothetical protein  36.75 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>