16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4291 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4291  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2098  hypothetical protein  27.67 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0289  hypothetical protein  27.61 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.929671  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0383  hypothetical protein  24.81 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0631  hypothetical protein  26.88 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107314  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5987  hypothetical protein  48.48 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4187  hypothetical protein  30.25 
 
 
366 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637966  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3136  hypothetical protein  27.63 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2983  hypothetical protein  25.8 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2509  hypothetical protein  24.23 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  26.46 
 
 
594 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1097  hypothetical protein  43.55 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2855  hypothetical protein  43.55 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2702  hypothetical protein  43.55 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  23.15 
 
 
518 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  23.85 
 
 
519 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>