18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4061 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  100 
 
 		 155 aa  306  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  67.74 
 
 		 150 aa  204  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  70.32 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  70.32 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  70.32 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  64.52 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  64.52 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  69.68 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  69.68 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  75 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  55.41 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  41.86 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  41.86 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  52 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  51.56 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  52.17 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  50.91 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  46.81 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>