17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2340 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2340  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  251  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.897475  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1239  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212836  normal  0.226179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1612  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00226561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1046  hypothetical protein  31.71 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000643846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0949  hypothetical protein  35.9 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1239  hypothetical protein  34.17 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.341042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1674  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.664876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0970  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1885  hypothetical protein  34.29 
 
 
302 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0070787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1678  hypothetical protein  33.01 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1624  hypothetical protein  32.38 
 
 
302 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1659  hypothetical protein  30.48 
 
 
302 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1934  hypothetical protein  32.38 
 
 
302 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1858  hypothetical protein  32.38 
 
 
302 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4227900000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3519  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2516  DoxX family protein  33.33 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327556  normal  0.323158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>