77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1817 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  81.33 
 
 		 168 aa  289  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  84.91 
 
 		 159 aa  285  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  76.79 
 
 		 169 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  76.19 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  76.19 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  76.19 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  74.4 
 
 		 169 aa  275  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  73.81 
 
 		 169 aa  274  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  74.25 
 
 		 169 aa  273  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  76.51 
 
 		 168 aa  273  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  73.21 
 
 		 169 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  73.21 
 
 		 169 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  72.62 
 
 		 169 aa  264  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  69.64 
 
 		 169 aa  263  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  68.86 
 
 		 167 aa  250  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  58.43 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  58.68 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  57.83 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  57.49 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  57.14 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  56.55 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  48.81 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  50.3 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  49.39 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  48.78 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.83 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  50.96 
 
 		 210 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  47.02 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  50.9 
 
 		 212 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  44.05 
 
 		 175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  45.78 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  46.25 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  42.86 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  43.56 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  45.24 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  41.32 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  45.11 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  34.67 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  33.7 
 
 		 197 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  33.15 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  33.14 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  33.13 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  29.3 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  30.46 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.52 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.86 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.4 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  29.24 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  30.36 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  28.74 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  32.65 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.47 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  31.19 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  38.2 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  23.78 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  26.96 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  26.09 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  25.2 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.29 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  32.1 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  32.95 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  27.52 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>