20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0398 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.980597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4195  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0263  hypothetical protein  68.75 
 
 		 101 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0309  hypothetical protein  69.15 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3840  hypothetical protein  69.15 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0300  hypothetical protein  69.15 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3644  hypothetical protein  68.09 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0331  hypothetical protein  67.74 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4155  hypothetical protein  64.89 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3658  hypothetical protein  64.58 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4037  hypothetical protein  64.89 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3960  hypothetical protein  64.89 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4062  hypothetical protein  63.83 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.129489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0283  hypothetical protein  62.77 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000469346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0408  hypothetical protein  60.22 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.392247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3323  hypothetical protein  59.57 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0047643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0225  hypothetical protein  37.66 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002093  aminopeptidase N  36 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2577  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00343  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>