35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0215 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0215  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2708  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.58 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1013  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.96 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3094  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.41 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3441  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.41 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0707  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.08 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0206  normal  0.431639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0177  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.45 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5978  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.41 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2223  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.71 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4472  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.65 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5139  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.64 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  hitchhiker  0.00632638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00821  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.03 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0976137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0608  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.93 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5694  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.78 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3112  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.55 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6225  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.7 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4538  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.69 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0686  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.56 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1972  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.7 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.906613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2764  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.91 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0881  hypothetical protein  32.73 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7247  ethyl tert-butyl ether degradation protein, EthD  28.7 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.229987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2641  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.13 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1640  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.96 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2867  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.13 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169776  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4718  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3503  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.27 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.42 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2087  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.85 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2106  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.85 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.217375 
 
 
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NC_008062  Bcen_5990  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.85 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3870  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.93 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1877  EthD  27.36 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_2334  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.18 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00612684  normal  0.644511 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2068  hypothetical protein  24.77 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
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