15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2047 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2047  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.87 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2851  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.48842e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2324  carboxymuconolactone decarboxylase  36.47 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2557  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.059433  normal  0.792105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  34.18 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.77 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  44 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.65 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  43.64 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>