15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0562 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0562  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  353  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000215418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1522  hypothetical protein  29.88 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154678  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1018  hypothetical protein  33.91 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1067  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2600  hypothetical protein  33.01 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0479098  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0836  hypothetical protein  27.65 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000286037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1907  hypothetical protein  27.54 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1704  hypothetical protein  36.78 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.781571  normal  0.28438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06280  hypothetical protein  28.16 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000337732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3505  hypothetical protein  27.45 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1281  hypothetical protein  25.15 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1782  hypothetical protein  23.91 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0999  hypothetical protein  21.39 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000078149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1041  lipoprotein, putative  21.66 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2660  hypothetical protein  22.6 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000418114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>