13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5318 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5318  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3440  hypothetical protein  39.63 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380751  hitchhiker  0.000505878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3431  hypothetical protein  43.07 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.396813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2274  hypothetical protein  36.92 
 
 		 130 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0258058  hitchhiker  0.00291936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1067  hypothetical protein  42.34 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0565817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0034  hypothetical protein  29.26 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2429  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.322551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2351  hypothetical protein  30.56 
 
 		 146 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1582  hypothetical protein  29.53 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101201  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1177  hypothetical protein  32.33 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0135  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.770555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3622  hypothetical protein  39.73 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4810  hypothetical protein  27.87 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176299  normal  0.45074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>