14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3899 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3110  hypothetical protein  73.24 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2170  hypothetical protein  78.79 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44250  acyl-carrier protein  34.62 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1686  phosphopantetheine-binding  36.67 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  20 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02853  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3157  putative acyl carrier protein  26.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3444  putative acyl carrier protein  26.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0716  phosphopantetheine-binding  26.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3262  putative acyl carrier protein  26.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  36 
 
 		 128 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2715  hypothetical protein  41.86 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>