31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3680 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3680  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2794  hypothetical protein  67.86 
 
 
87 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617961  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2865  hypothetical protein  64.29 
 
 
91 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.064843  normal  0.0210484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0762  hypothetical protein  63.1 
 
 
91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0129  hypothetical protein  63.1 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280117  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0844  hypothetical protein  62.96 
 
 
88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3367  hypothetical protein  60.71 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0713  hypothetical protein  63.75 
 
 
91 aa  103  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39863  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1208  hypothetical protein  60.49 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3527  hypothetical protein  60.49 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239043  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3019  hypothetical protein  53.66 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3813  hypothetical protein  54.22 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0367  hypothetical protein  59.76 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3172  hypothetical protein  60.81 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0527  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7428  hypothetical protein  58.97 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0968962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3913  hypothetical protein  59.74 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3072  hypothetical protein  58.44 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288169  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  56.47 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3180  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0603995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1516  hypothetical protein  54.32 
 
 
87 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.184159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3343  hypothetical protein  56.41 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0429346  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7726  hypothetical protein  55.42 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0513086  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4018  hypothetical protein  54.32 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835397  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1038  hypothetical protein  57.89 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0983054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1486  hypothetical protein  56.58 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3836  hypothetical protein  50.63 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.071209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1980  hypothetical protein  53.33 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3549  hypothetical protein  51.95 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.242285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2328  hypothetical protein  50.65 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1811  hypothetical protein  52 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>