13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3327 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3327  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  hitchhiker  0.00248328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1556  hypothetical protein  42.74 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1505  hypothetical protein  41.88 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663533  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3662  hypothetical protein  43.9 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4339  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3695  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00458949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2791  hypothetical protein  34.57 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3720  hypothetical protein  37.07 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11902  hypothetical protein  36.75 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.599567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3326  hypothetical protein  36.07 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0497239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2761  hypothetical protein  33.74 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2805  hypothetical protein  33.74 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.802396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3047  hypothetical protein  35.19 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538409  normal  0.158254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>