12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2412 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3543  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  34.96 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0985  hypothetical protein  28.97 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2992  hypothetical protein  30.37 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3426  hypothetical protein  26.99 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00293967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4870  hypothetical protein  29.2 
 
 		 955 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4282  hypothetical protein  27.56 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1945  hypothetical protein  26.72 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5532  hypothetical protein  27.09 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4943  hypothetical protein  25.81 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4176  hypothetical protein  27.88 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.616398  normal  0.713554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>