18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2336 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  44.07 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  39.57 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  28.7 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  32.12 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  39.56 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  41.77 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  33.08 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  25.99 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  36.61 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  23.64 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  20.96 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  38.27 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  25.56 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  22.83 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0978  hypothetical protein  28.85 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>