28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1783 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  307  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000247  permease  37.74 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4237  hypothetical protein  40.26 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4129  hypothetical protein  40.26 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402697  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0422  hypothetical protein  34.87 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3390  hypothetical protein  39.61 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01185  hypothetical protein  33.56 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4463  hypothetical protein  42.47 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0446649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0037  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0250  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0037  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1906  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74595  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1681  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1856  hypothetical protein  39.38 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2696  hypothetical protein  39.38 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3271  hypothetical protein  39.38 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1862  hypothetical protein  35.06 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588861  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2903  hypothetical protein  33.99 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3348  hypothetical protein  34.87 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1716  hypothetical protein  38.13 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00090  predicted membrane protein  32.39 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2683  hypothetical protein  36.43 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3769  hypothetical protein  26.92 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3588  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4272  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3786  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0426513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1596  hypothetical protein  35.83 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3836  hypothetical protein  39.02 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  0.546364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>