66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0515 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  51.87 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  51.58 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  38.25 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  34.59 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  33.52 
 
 		 175 aa  88.2  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  34.1 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  36.13 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  32.16 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  30.73 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  30.86 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  29.31 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  30.86 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  30.86 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  30.36 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  28.74 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  30.29 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  27.84 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  30.64 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  35.12 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  29.28 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  30.56 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  29.94 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.82 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  32.6 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  34.27 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  28.99 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  26.86 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  30.81 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  29.55 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  36.08 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  30.54 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  29.17 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  25.54 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  27.59 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  29.94 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  32.7 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  29.34 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  29.31 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  28.14 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  27.75 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  26.59 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  41.94 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  27.54 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  27.33 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.2 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  30.09 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  31.79 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  28.17 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  31.43 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  25.49 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  32.84 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  25.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  41.94 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  34.12 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  34.12 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>