40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0261 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0261  toxic anion resistance family protein  100 
 
 
395 aa  803    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343887  normal  0.0699835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2959  toxic anion resistance  74.79 
 
 
415 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.982902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2308  toxic anion resistance  68.75 
 
 
403 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0765  toxic anion resistance family protein  56.54 
 
 
414 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2419  toxic anion resistance  53.17 
 
 
414 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0839824  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2100  hypothetical protein  53.44 
 
 
414 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00242113  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2138  toxic anion resistance family protein  52.53 
 
 
417 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290254  hitchhiker  0.00275105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3316  toxic anion resistance family protein  52.32 
 
 
420 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2919  toxic anion resistance  48.93 
 
 
419 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220942  normal  0.0480971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1633  hypothetical protein  49.6 
 
 
406 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3213  hypothetical protein  52.08 
 
 
384 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446815  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3058  toxic anion resistance family protein  50.27 
 
 
405 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3025  toxic anion resistance family protein  48.41 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00868928  hitchhiker  0.000634734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  49.47 
 
 
399 aa  355  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0931  toxic anion resistance  45.87 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.224852  normal  0.413842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6387  toxic anion resistance family protein  50.83 
 
 
409 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550341  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00690  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  37.27 
 
 
407 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0312  hypothetical protein  33.42 
 
 
424 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.722745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2217  hypothetical protein  32.45 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3493  toxic anion resistance family protein  34.34 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603001  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4059  toxic anion resistance family protein  33.42 
 
 
406 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1518  toxic anion resistance family protein  34.21 
 
 
412 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150292  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1786  toxic anion resistance family protein  26.05 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2555  hypothetical protein  26.27 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2208  hypothetical protein  26.05 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0466629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2250  hypothetical protein  26.05 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00532335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2458  hypothetical protein  26.05 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2287  hypothetical protein  26.05 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2475  hypothetical protein  26.27 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2266  toxic anion resistance family protein  25 
 
 
387 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0678634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2414  hypothetical protein  25.28 
 
 
370 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2491  hypothetical protein  25.75 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000702786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2916  hypothetical protein  25.28 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.233445 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0848  toxic anion resistance family protein  24.63 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.571741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1579  toxic anion resistance family protein  22.74 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.818235  normal  0.519826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1941  toxic anion resistance family protein  23.2 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.0249977 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1459  hypothetical protein  23.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1971  toxic anion resistance family protein  21.82 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1993  toxic anion resistance family protein  25.42 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00104364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1660  tellurite resistance protein  23.08 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>