18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0206 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  25.97 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  23.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  26.11 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  25.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  26.11 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  26.12 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  30.77 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  26.12 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  29.06 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5905  hypothetical protein  27.81 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  27.91 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  21.43 
 
 		 207 aa  44.3  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  30.53 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  24.17 
 
 		 199 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>