22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1395    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 764 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  30.49 
 
 		 802 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  31.2 
 
 		 809 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  31.2 
 
 		 809 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  31.06 
 
 		 809 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  29.33 
 
 		 811 aa  217  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  28.9 
 
 		 804 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  27.91 
 
 		 831 aa  188  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  28.63 
 
 		 784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  32.31 
 
 		 905 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  26.51 
 
 		 884 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  26.47 
 
 		 873 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  25.53 
 
 		 713 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  25.14 
 
 		 919 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  27.08 
 
 		 820 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  27.56 
 
 		 706 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  25.78 
 
 		 835 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  26.72 
 
 		 718 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  25.79 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1447  hypothetical protein  30.11 
 
 		 733 aa  45.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  28.66 
 
 		 751 aa  44.3  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>