13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28950  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.375135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1029  hypothetical protein  52.05 
 
 		 73 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1705  hypothetical protein  50.68 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.0850531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1998  hypothetical protein  47.22 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1404  hypothetical protein  62 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.271917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2536  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.574552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12541  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000783221  hitchhiker  0.002948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3643  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3716  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0490349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3656  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0708542  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1368  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5630  hypothetical protein  40.74 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4119  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.503951  normal  0.548998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>